ICAN Omics metabolomics : plateforme de profilage de métabolites

Qu'est-ce que la métabolomique ?

La métabolomique correspond à l’étude de manière exhaustive de l’ensemble des petites molécules organiques (inférieur à 1000 Da). Les métabolites et les réactions biochimiques associés constituent un socle commun au bon fonctionnement de l’ensemble des organismes avec dans certains cas quelques spécificités.
Pour cela, il est possible d’analyser les métabolites contenus dans les matrices biologiques (plasma, sérum, tissus, fèces…) afin de chercher les dérégulations, par rapport à une population contrôle par exemple.
Le métabolisme repose sur un équilibre fragile : il répond sans cesse à des stimuli externes récurrents comme l’alimentation, ou à des stimulis plus spécifiques tels que l’apparition d’une pathologie.
L’objectif final est de détecter et quantifier ces métabolites sortant de la norme afin d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies (meilleure stratification des patients pour un traitement plus personnalisé, adaptation de leur mode de vie…).

L’expertise de la plateforme ICAN Omics metabolomics est de proposer différentes approches afin de fournir une aide dans le développement d’une médecine de précision. Avec une simple prise de sang et une signature incluant différents métabolites spécifiques, il est possible d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies.
Nos approches se basent sur le profilage d’un large nombre de métabolites en utilisant des compétences multidisciplinaires combinant des outils bio-informatiques, statistiques et des bases de données biochimiques pour l’interprétation des résultats à l’aide d’un spectromètre de masse à haute résolution couplé à des systèmes chromatographiques.
Nos approches sont adaptées à la recherche de biomarqueurs candidats à des fins de diagnostiques, pronostiques et de réponse à un traitement.
D’autres approches dites ciblées (ou de profilage) reposent sur des marqueurs publiés ou connus afin de les vérifier et/ou valider leur pertinence sur une pathologie, ou représenter une signature spécifique d’une population.

Étude du métabolome
Acquisition et interprétation de profils métabolomiques
Analyse et quantification de plusieurs familles de métabolites
Conseil et mise en place des dosages métabolomiques
Annotation, identification et élucidation structurale des métabolites (HRMS, MS/MS)
Développement et réalisation de méthodes spécifiques (‘Custom method’)

Label IBiSA renouvelé en 2023. En savoir plus.

Quantification absolue des acides aminés, voie du tryptophane, voie du métabolisme de la choline (TMAO, Choline…), acide gras à courte chaine (SCFAs), acides biliaires (en dvlpt)

Etude du métabolome globale par l’intermédiaire de plusieurs méthodes chromatographiques
Détection de plus de 200 métabolites dans les biofluides (plasma-sérum)

Détection et quantification relative de composés en lien avec le microbiote et appartenant à la famille

Méthode 1 : acides aminés, composés organiques, phénols, méthylamines et quelques indoles
Méthode 2 : Acylcarnitines, acides gras libres et acides biliaires

Contacter le responsable opérationnel pour plus d’informations – Farid Ichou f.ichou@ihuican.org

Philippe Lesnik (DR, UMR ICAN 1166)

Directeur scientifique

Farid Ichou (IR, ICAN)

Responsable opérationnel

Formation : plateforme référence du parcours Biomics du master STA2E de Université Paris Est Créteil
Réseaux locaux : UMS RésOmique (Sorbonne Université), AP-HP, Inserm U1166
Réseaux nationaux : MetaboHub, RFMF, Consortium Microbiote INSERM
Réseaux internationaux : Metabomeeting, european regional metabolomics networks, Metabolomics Society

L’accès à notre plateforme se fait par l’intermédiaire d’une demande analytique.

La démarche après réception du « request form » est la suivante :

Soumission de la request form à la plateforme via “demande Analytique” au responsable de la plateforme Farid Ichou : f.ichou@ihuican.org
Évaluation du projet et établissement d’une proposition tarifaire
Validation du cahier des charges et signature d’un devis/convention
Réception des échantillons
Réalisation des travaux selon le cahier des charges (ou le devis)
Présentation du rapport final d’étude