Fondation pour l’Innovation
en Cardiométabolisme et Nutrition

Recherche médicale cardiométabolisme IHU ICAN

ICAN Omics metabolomics

Qu’est-ce que la métabolomique ?

  • La métabolomique correspond à l’étude de manière exhaustive de l’ensemble des petites molécules organiques (inférieur à 1000 Da). Les métabolites et les réactions biochimiques associés constituent un socle commun au bon fonctionnement de l’ensemble des organismes avec dans certains cas quelques spécificités.
  • Pour cela, il est possible d’analyser les métabolites contenus dans les matrices biologiques (plasma, sérum, tissus, fèces…) afin de chercher les dérégulations, par rapport à une population contrôle par exemple.
  • Le métabolisme repose sur un équilibre fragile : il répond sans cesse à des stimuli externes récurrents comme l’alimentation, ou à des stimulis plus spécifiques tels que l’apparition d’une pathologie.
  • L’objectif final est de détecter et quantifier ces métabolites sortant de la norme afin d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies (meilleure stratification des patients pour un traitement plus personnalisé, adaptation de leur mode de vie…).

La plateforme ICAN Omics metabolomics

  • L’expertise de la plateforme ICAN Omics metabolomics est de proposer différentes approches afin de fournir une aide dans le développement d’une médecine de précision. Avec une simple prise de sang et une signature incluant différents métabolites spécifiques, il est possible d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies.
  • Nos approches se basent sur le profilage d’un large nombre de métabolites en utilisant des compétences multidisciplinaires combinant des outils bio-informatiques, statistiques et des bases de données biochimiques pour l’interprétation des résultats à l’aide d’un spectromètre de masse à haute résolution couplé à des systèmes chromatographiques.
  • Nos approches sont adaptées à la recherche de biomarqueurs candidats à des fins de diagnostiques, pronostiques et de réponse à un traitement.
  • D’autres approches dites ciblées (ou de profilage) reposent sur des marqueurs publiés ou connus afin de les vérifier et/ou valider leur pertinence sur une pathologie, ou représenter une signature spécifique d’une population.

Notre expertise

  • Étude du métabolome
  • Acquisition et interprétation de profils métabolomiques
  • Analyse et quantification de plusieurs familles de métabolites
  • Conseil et mise en place des dosages métabolomiques
  • Annotation, identification et élucidation structurale des métabolites (HRMS, MS/MS)
  • Développement et réalisation de méthodes spécifiques (‘Custom method’)

Certifications

Label IBiSA renouvelé en 2023. En savoir plus.

Approche ciblée

  • Quantification absolue des acides aminés, voie du tryptophane, voie du métabolisme de la choline (TMAO, Choline…), acide gras à courte chaine (SCFAs), acides biliaires (en dvlpt)

Approche non ciblée

  • Etude du métabolome globale par l’intermédiaire de plusieurs méthodes chromatographiques
  • Détection de plus de 200 métabolites dans les biofluides (plasma-sérum)

Méthode de profilage

Détection et quantification relative de composés en lien avec le microbiote et appartenant à la famille

  • Méthode 1 : acides aminés, composés organiques, phénols, méthylamines et quelques indoles
  • Méthode 2 : Acylcarnitines, acides gras libres et acides biliaires

Matrices biologiques d’études

  • Sérum-Plasma, LCR, urines, fèces, Caecum, PBMC et cellules gliales.
  • Autres matrices sous conditions d’études pilotes

Contacter le responsable opérationnel pour plus d’informations – Farid Ichou f.ichou@ihuican.org

Comité de pilotage

Philippe Lesnik (DR, UMR ICAN 1166)

Directeur scientifique

Farid Ichou (IR, ICAN)

Responsable opérationnel

 Comité scientifique

  • Dr F. Fenaille (CEA)
  • Dr. I. Gomperts Boneca (Institut Pasteur)
  • Dr F. Lamari (APHP)
  • Dr W. Le Goff (UMR ICAN 1166)
  • Pr F. Mochel (ICM)

Réseau

Conditions d’accès

L’accès à notre plateforme se fait par l’intermédiaire d’une demande analytique.

La démarche après réception du « request form » est la suivante :

  • Évaluation du projet et établissement d’une proposition tarifaire
  • Validation du cahier des charges et signature d’un devis/convention
  • Réception des échantillons
  • Réalisation des travaux selon le cahier des charges (ou le devis)
  • Présentation du rapport final d’étude

Contact

Farid Ichou (IR, ICAN)

f.ichou@ihuican.org

01 84 82 77 68

47-48 bd de l’hôpital
75013 Paris
ICAN – bât E3M – 6ème étage

Publications majeures ICAN Omics

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