Qu’est-ce que la métabolomique ?
- La métabolomique correspond à l’étude de manière exhaustive de l’ensemble des petites molécules organiques (inférieur à 1000 Da). Les métabolites et les réactions biochimiques associés constituent un socle commun au bon fonctionnement de l’ensemble des organismes avec dans certains cas quelques spécificités.
- Pour cela, il est possible d’analyser les métabolites contenus dans les matrices biologiques (plasma, sérum, tissus, fèces…) afin de chercher les dérégulations, par rapport à une population contrôle par exemple.
- Le métabolisme repose sur un équilibre fragile : il répond sans cesse à des stimuli externes récurrents comme l’alimentation, ou à des stimulis plus spécifiques tels que l’apparition d’une pathologie.
- L’objectif final est de détecter et quantifier ces métabolites sortant de la norme afin d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies (meilleure stratification des patients pour un traitement plus personnalisé, adaptation de leur mode de vie…).

La plateforme ICAN Omics metabolomics
- L’expertise de la plateforme ICAN Omics metabolomics est de proposer différentes approches afin de fournir une aide dans le développement d’une médecine de précision. Avec une simple prise de sang et une signature incluant différents métabolites spécifiques, il est possible d’améliorer la prévention et/ou le traitement de diverses pathologies.
- Nos approches se basent sur le profilage d’un large nombre de métabolites en utilisant des compétences multidisciplinaires combinant des outils bio-informatiques, statistiques et des bases de données biochimiques pour l’interprétation des résultats à l’aide d’un spectromètre de masse à haute résolution couplé à des systèmes chromatographiques.
- Nos approches sont adaptées à la recherche de biomarqueurs candidats à des fins de diagnostiques, pronostiques et de réponse à un traitement.
- D’autres approches dites ciblées (ou de profilage) reposent sur des marqueurs publiés ou connus afin de les vérifier et/ou valider leur pertinence sur une pathologie, ou représenter une signature spécifique d’une population.

Notre expertise
- Étude du métabolome
- Acquisition et interprétation de profils métabolomiques
- Analyse et quantification de plusieurs familles de métabolites
- Conseil et mise en place des dosages métabolomiques
- Annotation, identification et élucidation structurale des métabolites (HRMS, MS/MS)
- Développement et réalisation de méthodes spécifiques (‘Custom method’)

Approche ciblée
- Quantification absolue des acides aminés, voie du tryptophane, voie du métabolisme de la choline (TMAO, Choline…), acide gras à courte chaine (SCFAs), acides biliaires (en dvlpt)
Approche non ciblée
- Etude du métabolome globale par l’intermédiaire de plusieurs méthodes chromatographiques
- Détection de plus de 200 métabolites dans les biofluides (plasma-sérum)
Méthode de profilage
Détection et quantification relative de composés en lien avec le microbiote et appartenant à la famille
- Méthode 1 : acides aminés, composés organiques, phénols, méthylamines et quelques indoles
- Méthode 2 : Acylcarnitines, acides gras libres et acides biliaires
Matrices biologiques d’études
- Sérum-Plasma, LCR, urines, fèces, Caecum, PBMC et cellules gliales.
- Autres matrices sous conditions d’études pilotes
Contacter le responsable opérationnel pour plus d’informations – Farid Ichou f.ichou@ihuican.org

Comité de pilotage
Philippe Lesnik (DR, UMR ICAN 1166)
Directeur scientifique
Farid Ichou (IR, ICAN)
Responsable opérationnel
Comité scientifique
- Dr F. Fenaille (CEA)
- Dr. I. Gomperts Boneca (Institut Pasteur)
- Dr F. Lamari (APHP)
- Dr W. Le Goff (UMR ICAN 1166)
- Pr F. Mochel (ICM)
Réseau

Conditions d’accès
L’accès à notre plateforme se fait par l’intermédiaire d’une demande analytique.
La démarche après réception du « request form » est la suivante :
- Soumission de la request form à la plateforme via “demande Analytique” au responsable de la plateforme Farid Ichou : f.ichou@ihuican.org
- Évaluation du projet et établissement d’une proposition tarifaire
- Validation du cahier des charges et signature d’un devis/convention
- Réception des échantillons
- Réalisation des travaux selon le cahier des charges (ou le devis)
- Présentation du rapport final d’étude
Contact
Farid Ichou (IR, ICAN)
01 84 82 77 68
47-48 bd de l’hôpital
75013 Paris
ICAN – bât E3M – 6ème étage
Publications majeures ICAN Omics
Dernières publications
12/03/2024
15/12/2023
17/10/2023
01/10/2023
Deleterious functional consequences of perfluoroalkyl substances accumulation into the myelin sheath
01/09/2023
23/08/2023
27/07/2023
28/03/2023
09/12/2022
Impacts of a high-fat diet on the metabolic profile and the phenotype of atrial myocardium in mice
19/05/2022
13/04/2022
Publications plus anciennes
28/10/2020
13/08/2020
10/01/2020
Exploring the Bacterial Impact on Cholesterol Cycle: A Numerical Study
27/11/2019
The intestinal microbiota regulates host cholesterol homeostasis
11/10/2019
10/03/2017
21/01/2016
08/11/2014
Circulating phospholipid profiling identifies portal contribution to NASH signature in obesity
01/11/2013
Unraveling the complexities of the HDL lipidome
03/10/2013